¿Cuáles son los efectos secundarios de la melatonina?

Publicado: 22 de septiembre de 2025
Modificado: 29 de septiembre de 2025

Dormir bien es mucho más que un placer: es una necesidad vital para tu salud 🛌💤. La melatonina, conocida como la hormona natural del sueño, se ha convertido en un suplemento estrella para quienes buscan conciliar el sueño más rápido o mejorar la calidad del descanso.

Pero… ⚠️ ¿es realmente tan segura como dicen? ¿Puede provocar efectos secundarios si la tomas durante semanas o meses?

Y lo más importante: 💡¿hay riesgos ocultos que deberías conocer antes de usarla?

En este artículo te contamos, con base científica 📊, qué efectos secundarios puede tener la melatonina, qué grupos de población requieren más precaución y en qué casos conviene usarla con supervisión médica.

⚠️ Aviso La información de este artículo está basada en las últimas revisiones sistemáticas publicadas. Todos los datos provienen de estas fuentes a no ser que se indique lo contrario: revisión, revisión, revisión. En la sección de bibliografía, te dejamos algunas revisiones con explicaciones fisiológicas, por si te apetece profundizar. Y, por supuesto, antes de tomar un suplemento, consulta con tu médico.

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Efectos secundarios más comunes de la melatonina

Los ensayos clínicos muestran que los efectos adversos de la melatonina suelen ser poco frecuentes, leves o moderados 🧠 y, en la mayoría de los casos, se resuelven solos o al suspender el tratamiento.

Regular producción de melatonina
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📸👆 La luz que perciben nuestros ojos regula la producción de melatonina 🌓, la hormona que indica al cuerpo cuándo es hora de dormir. La señal luminosa viaja desde la retina hasta una zona del cerebro llamada núcleo supraquiasmático (SCN), que actúa como un “reloj biológico” interno.

Desde ahí, se envían órdenes a la glándula pineal (PG) para aumentar o reducir la liberación de melatonina a la sangre, dependiendo de si es de día ☀️ o de noche 🌙. Esta hormona atraviesa la barrera hematoencefálica (BBB) y ajusta el ciclo sueño–vigilia, ayudando a sincronizar nuestro reloj interno con el ambiente. Fuente

Dolor de cabeza y molestias digestivas

📊 En estudios controlados, el dolor de cabeza afectó a menos del 1 % de los pacientes (0,74 % frente a placebo).

También se notificaron molestias gastrointestinales, como diarrea o dolor abdominal, con una incidencia muy baja (0,18 %).

Estos síntomas suelen durar pocos días y no requieren ajustar la dosis.

Cambios de humor y sensación de confusión

Se han descrito casos aislados de bajo estado de ánimo, ansiedad o confusión leve, sin diferencias relevantes respecto a placebo.

En pacientes con trastornos del neurodesarrollo (TDAH, TEA), los cambios emocionales aparecieron con frecuencia similar en ambos grupos 🔍.

¿Provoca la melatonina somnolencia excesiva o confusión?

⚠️ La somnolencia diurna es uno de los efectos más comunes (1,66 % de los pacientes). En algunos casos se relaciona con tomar la dosis demasiado tarde, lo que prolonga su efecto hasta el día siguiente.

También se ha documentado mareo leve (0,74 %) y una rara sensación de frío corporal o hipotermia (0,62 %).

¿Es peligrosa la melatonina a largo plazo?

Aunque la evidencia apunta a que la melatonina es segura, hay menos datos sobre tratamientos de varios meses o años ⏳.

Posibles funciones de la melatonina
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📸👆 Esta ilustración muestra las posibles funciones de la melatonina más allá de su papel principal en regular el ritmo circadiano 🌓, es decir, el ciclo natural de sueño y vigilia.

En la parte central se ven trastornos del sueño como insomnio, síndrome de piernas inquietas (RLS), somnolencia diurna excesiva (EDS), trastorno de conducta del sueño REM (RBD) y otros problemas del sueño (SBD), que podrían mejorar con melatonina según algunos estudios.

A su alrededor aparecen efectos potenciales descritos en investigaciones preliminares o modelos animales, pero que aún no están confirmados de forma concluyente en humanos:

  • Restauración del ritmo circadiano ⏱️.
  • Acción antioxidante y posible protección frente al daño por radicales libres.
  • Efecto antiinflamatorio y modulación del sistema inmunitario.
  • Prevención del daño celular (anti-apoptótico).
  • Reducción de la excitotoxicidad neuronal (daño por exceso de estimulación nerviosa).
  • Protección frente a alteraciones sinápticas (fallos en la comunicación entre neuronas).

Algunos investigadores plantean que estos mecanismos podrían tener interés para personas con enfermedad de Parkinson (PD) y otros trastornos neurodegenerativos.

Pero hasta ahora la mayor parte de la evidencia es experimental o basada en estudios pequeños, por lo que se considera un grado de hipótesis y no un beneficio clínico demostrado. Fuente

Impacto en el sistema hormonal

🧪 Algunos estudios abiertos han observado cambios leves en niveles de LH, FSH o prolactina 📉. Estos podrían explicar alteraciones menstruales como menorragia en casos aislados.

Sin embargo, la relación causal no está confirmada y la mayoría de los pacientes no presenta cambios endocrinos relevantes.

¿Puede afectar a la pubertad o fertilidad?

🧬 Se han descrito muy pocos casos de pubertad retrasada, generalmente en niños con daño cerebral grave o condiciones de base complejas.

La evidencia es inconsistente, pero se recomienda prudencia en menores prepuberales hasta disponer de más estudios.

Melatonina en diferentes grupos de población

Administración de melatonina en la noche
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📸👆 Este gráfico muestra cómo la administración de melatonina puede modificar el momento en que el cuerpo inicia y finaliza su “noche biológica” 🌙, es decir, el periodo natural en el que la hormona se encuentra elevada en sangre.

  • La curva negra representa el patrón normal de producción de melatonina, que comienza a subir al anochecer, alcanza su pico durante la noche y desciende al amanecer.
  • La curva roja indica un adelanto de fase ⏩: la melatonina comienza a liberarse antes, lo que puede ayudar a personas que se duermen y se despiertan demasiado tarde (retraso de fase).
  • La curva azul indica un retraso de fase ⏪: la liberación de melatonina empieza más tarde, lo que podría ser útil para quienes tienden a dormirse demasiado temprano (adelanto de fase).

En la parte inferior, se indica que el momento de la toma es clave: tomarla en ciertas horas de la tarde puede adelantar el reloj biológico, mientras que administrarla por la mañana o en momentos específicos puede retrasarlo.

Melatonina en personas mayores

🧓 Con el envejecimiento, el metabolismo de la melatonina se enlentece, lo que puede prolongar su efecto y aumentar el riesgo de somnolencia diurna si la dosis es alta o se administra tarde.

Uso en mujeres embarazadas o en periodo de lactancia

⚠️ No existen ensayos clínicos en embarazadas o lactantes. Se desaconseja su uso por la falta de evidencia y por su capacidad de pasar a la leche materna 🍼.

Riesgos en niños y adolescentes

En niños y adolescentes, los efectos adversos suelen ser leves y similares a placebo. Las preocupaciones se centran en la posible influencia sobre la maduración sexual y en su uso prolongado sin seguimiento médico 🔍.

¿Es segura la melatonina en pacientes quirúrgicos o críticos?

Este paper no se centra en cirugía o UCI, pero sí documenta que incluso en pacientes con comorbilidades (diabetes, cardiopatías, trastornos neurológicos) 💊, los efectos adversos fueron mínimos y raramente graves.

Interacciones de la melatonina con medicamentos y otras sustancias

Interacciones de la melatonina
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Muchos compuestos considerados “naturales”, interacciónan con el metabolismo de fármacos. La melatonina no es una excepción.

Antidepresivos, anticoagulantes y anticonceptivos

💡 Fármacos como fluvoxamina, cafeína y anticonceptivos orales pueden aumentar los niveles de melatonina en sangre. Esto podría potenciar la sedación o prolongar sus efectos.

Otras medicaciones, como rifampicina o algunos antiepilépticos, pueden reducir su concentración.

Alcohol, cafeína y otros sedantes

🍷 El alcohol y otros hipnóticos pueden potenciar los efectos sedantes y afectar el rendimiento psicomotor ⚠️.
Se han descrito casos de sedación intensa cuando se combina con citalopram.

Posibles efectos adversos poco frecuentes o raros

  • 🎨 Cambios en la pigmentación de la piel: detectados en un pequeño número de pacientes tras uso prolongado.
  • Aumento de crisis epilépticas: solo en casos muy puntuales y sin confirmación causal.
  • ❤️ Síntomas cardiovasculares: como cambios en presión arterial, principalmente en pacientes que toman antihipertensivos.
  • 🌬️ Alteraciones respiratorias: se han planteado riesgos teóricos en asma nocturna, pero no hay evidencia concluyente.

Posibles efectos adversos graves de la melatonina

Aunque la melatonina presenta un perfil de seguridad favorable 🛡️, algunos estudios han evaluado riesgos poco frecuentes que requieren atención especial.

Nivel de hipótesis fisiológica
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📸👆 Este esquema muestra, a nivel de hipótesis fisiológica 🧪, cómo la melatonina podría actuar sobre las células a través de distintos receptores y rutas de señalización.

  • En la membrana celular, los receptores MT1 y MT2 activan o inhiben proteínas G, modulando enzimas como la adenilil ciclasa y la guanilil ciclasa, que regulan la producción de mensajeros intracelulares como el cAMP y el cGMP.
  • Estas señales pueden activar otras rutas como la fosfolipasa C (PLC), que genera moléculas señalizadoras (IP3 y DAG) implicadas en la liberación de calcio y la activación de proteínas específicas.
  • En el núcleo, la melatonina podría unirse a receptores como RZR/ROR, que influyen en la expresión de genes relacionados con el metabolismo, la inflamación y el ritmo circadiano.
  • En el citosol, se ha descrito un receptor adicional (MT3, identificado como la enzima quinona reductasa QR2), cuya relevancia funcional aún se investiga. Fuente

Efecto sobre las crisis epilépticas

🔍 En personas con epilepsia, los niveles bajos de melatonina endógena se han asociado con peor calidad del sueño. La suplementación podría mejorar el descanso y, en algunos casos, reducir la frecuencia o gravedad de las crisis.

📊 La mayoría de ensayos no encontró un aumento en el riesgo de convulsiones. En varios estudios se observó incluso una mejora clínica o una reducción de la actividad epiléptica nocturna.

⚠️ Sin embargo, las revisiones sistemáticas señalan que la evidencia aún es insuficiente para confirmar un efecto protector. No hay pruebas de que la melatonina sea proconvulsivante, pero se recomienda seguimiento médico en pacientes con epilepsia.

Posible retraso en la pubertad

🧬 La melatonina natural disminuye de forma notable justo antes del inicio de la pubertad.
Esto ha llevado a plantear si el uso prolongado podría retrasar la maduración sexual en menores.

📚 La evidencia es inconsistente:

  • Estudios en animales muestran que puede influir en los ciclos reproductivos.
  • En humanos, la mayoría de los ensayos no encontró cambios significativos en desarrollo sexual, peso o talla.
  • Algunos seguimientos a largo plazo reportaron casos aislados de retraso puberal, pero no se pudo confirmar relación causal.

💡 La hipótesis más estudiada es que la melatonina podría reducir la liberación de kisspeptina, un neuropéptido clave en la activación de las hormonas reproductivas.

Recomendaciones actuales

✅ La falta de datos concluyentes ha llevado a recomendar que la melatonina no sea tratamiento de primera línea para el insomnio crónico en menores prepuberales.
Esto se basa en precaución por falta de estudios, no en evidencia de daño confirmado.

⚠️ En niños y adolescentes que requieran melatonina por períodos prolongados, es clave un seguimiento médico periódico, incluyendo evaluación del desarrollo puberal.

Otros posibles efectos adversos endocrinos y reproductivos

Aunque los efectos hormonales de la melatonina no están completamente aclarados, algunos estudios sugieren que podría influir en diversas hormonas clave 🧪.

Grado de hipótesis fisiológica
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📸👆 Este diagrama ilustra, en un grado de hipótesis fisiológica 🧪, cómo la melatonina podría influir en la secreción de la hormona del crecimiento (GH).

  1. La glándula pineal, estimulada por la oscuridad 🌙 y modulada por señales de luz (parte superior derecha), produce melatonina.
  2. Esta melatonina llega a la hipófisis anterior (pituitaria) y se une a receptores específicos (Mel1b y Mel1c) presentes en las células adenohipofisarias.
  3. La activación de estos receptores modula la vía adenilil ciclasa / proteína quinasa A (AC/PKA), lo que influye en la actividad del factor de transcripción Pit-1.
  4. Pit-1 regula la expresión del gen de la hormona de crecimiento (GH), favoreciendo su síntesis y liberación hacia la sangre. Fuente

Influencia en la hormona del crecimiento (GH)

📊 En ensayos clínicos, la melatonina ha mostrado aumentar de forma leve los niveles de GH y su respuesta a la hormona liberadora de crecimiento.
Estos cambios fueron modestos y de corta duración.

⚠️ En dosis extremadamente altas (1 g/día), se observaron efectos inhibidores sobre la GH, pero estas dosis no son representativas de la práctica clínica.

Se desconoce si el aumento de GH en niños podría afectar al crecimiento óseo a largo plazo, por lo que se aconseja un uso prudente en menores.

Efectos sobre LH, FSH y prolactina

Algunos estudios han encontrado que la melatonina puede reducir la liberación de LH y FSH, y elevar los niveles de prolactina.
Estas alteraciones fueron ligeras y variables según la investigación.

💡 También se ha documentado una posible relación con disminución de la calidad seminal en hombres y casos aislados de amenorrea en mujeres.

En la década de 1990, dosis muy altas (300 mg/día) combinadas con progestágenos provocaron interrupción de los ciclos ováricos, lo que llevó a investigar su uso como anticonceptivo experimental.

Efectos sobre el metabolismo y la diabetes

La melatonina participa en la regulación de ritmos biológicos y procesos metabólicos 🩸.

Relación con resistencia a la insulina y glucosa

Estudios genéticos han vinculado variantes del receptor de melatonina con mayor riesgo de diabetes tipo 2 y peor control glucémico.

🔍 En mujeres sanas, dosis de 1 mg administradas por la mañana o tarde han mostrado reducir la tolerancia a la glucosa y la sensibilidad a la insulina.

En cambio, en pacientes con diabetes o síndrome metabólico, otros ensayos han encontrado mejoras leves en control glucémico y perfil lipídico tras varias semanas de tratamiento.

⚠️ Por precaución, en personas con diabetes o prediabetes se recomienda monitoreo de glucosa e insulina durante el uso prolongado.

Posible relación con el asma

Los estudios sobre la melatonina y el asma han ofrecido resultados contradictorios 🌬️.

Algunos trabajos han observado que niveles altos de melatonina se asocian con mayor incidencia de asma nocturna y con peor función respiratoria.

Esto podría deberse a que la melatonina influye en citocinas inflamatorias, que a su vez afectan la reactividad bronquial.

Posible efecto protector

Por el contrario, otros estudios en animales han sugerido que podría relajar el músculo bronquial y actuar como antioxidante. En pacientes asmáticos, se han reportado mejoras del sueño sin cambios en la gravedad del asma.

📌 En los ensayos revisados, no se observó empeoramiento ni mejora clara en síntomas asmáticos. Se recomienda más investigación antes de sacar conclusiones.

Efectos opuestos melatonina en asma
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📸👆 Este esquema resume los posibles efectos opuestos de la melatonina en el asma 🌬️, basados en hipótesis fisiológica y estudios con resultados contradictorios.

  • Parte superior: la producción de melatonina sigue un ciclo circadiano 🌓, alcanzando su punto más alto de noche. En algunos pacientes, este pico coincide con un empeoramiento de los síntomas asmáticos nocturnos.
  • Efectos negativos (en rojo):
    • Puede potenciar la broncoconstricción (estrechamiento de las vías respiratorias).
    • Podría reducir la eficacia de los broncodilatadores, limitando el alivio de los síntomas.
  • Efectos positivos (en azul):
    • Puede inhibir la secreción de moco, mejorando el flujo de aire.
    • Podría reducir la inflamación de las vías respiratorias, disminuyendo la hiperreactividad bronquial.

Otros posibles efectos adversos poco comunes

Además de los efectos más conocidos, algunos estudios han documentado reacciones inusuales relacionadas con el uso de melatonina ⚠️.

Empeoramiento de la apnea del sueño

En un pequeño estudio, pacientes con apnea obstructiva del sueño y tratamiento con CPAP mostraron aumento del índice de apnea-hipopnea y de la duración media de los episodios tras tomar melatonina.

💡 Otros ensayos no encontraron cambios y, en algunos casos, incluso se observaron mejoras en la calidad del sueño en pacientes con apnea y epilepsia.

Posible relación con enfermedades autoinmunes

🔍 Un caso clínico aislado describió el desarrollo de hepatitis autoinmune tras el inicio de melatonina en una paciente con insomnio.

Aunque no existe evidencia concluyente, su efecto inmunomodulador sugiere la necesidad de precaución en personas con enfermedades autoinmunes.

Hipotermia

Un informe describió a un niño con trastorno del espectro autista que, tras una sola dosis de 3 mg, presentó hipotermia grave (34 °C) durante dos días.

En el estudio MENDS, 6 niños reportaron hipotermia leve durante el tratamiento, aunque este efecto no se ha repetido en otros ensayos controlados.

Disminución de la temperatura rectal
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📸👆 Gráfico que muestra la disminución de la temperatura rectal (en °C) tras la administración de melatonina en personas jóvenes (cuadrados) y mayores (círculos). Tanto en un grupo como en otro, la temperatura empieza a descender alrededor de las 14:00 h y se mantiene más baja durante la tarde y la noche, favoreciendo el inicio del sueño 😴❄️. Las barras indican la variabilidad entre participantes. Fuente

Limitaciones de la evidencia disponible

La seguridad a largo plazo de la melatonina se basa en pocos ensayos clínicos prolongados ⏳. El más largo duró 29 semanas, siendo la mayoría de duración mucho menor.

📊 Entre las limitaciones principales:

  • Pocas muestras grandes: la mayoría de estudios incluye pocos pacientes, lo que dificulta detectar efectos poco frecuentes.
  • Falta de estudios doble ciego controlados con placebo.
  • Variabilidad en la recogida de datos: no siempre se usaron métodos sistemáticos para registrar efectos adversos.
  • Pacientes con múltiples enfermedades y medicación 💊: dificulta saber si los síntomas son por la melatonina o por otra causa.
  • Posibles conflictos de interés: algunos autores tenían vínculos con empresas fabricantes de melatonina.

En resumen, aunque la evidencia sugiere que la melatonina es segura en el corto plazo, la falta de datos sólidos a largo plazo obliga a ser prudentes en niños, embarazadas, lactantes y personas con enfermedades crónicas.

Conclusión

La melatonina presenta un perfil de seguridad muy favorable 🛡️: la mayoría de sus efectos secundarios son poco frecuentes, leves y transitorios, como dolor de cabeza, mareo o somnolencia diurna.

No obstante, la falta de estudios prolongados obliga a ser prudentes en niños, embarazadas, lactantes y personas con enfermedades crónicas, así como a vigilar posibles interacciones con medicamentos.

✅ En resumen, la evidencia parece indicar que es segura a corto plazo, pero su uso prolongado debería estar siempre supervisado por un profesional de la salud.

  1. Andersen, L.P.H. et al. (2016) ‘The Safety of Melatonin in Humans’, Clinical Drug Investigation, 36(3), pp. 169–175. Available at: https://doi.org/10.1007/s40261-015-0368-5.
  2. Appleton, R.E. et al. (2012) ‘The use of MElatonin in children with neurodevelopmental disorders and impaired sleep: a randomised, double-blind, placebo-controlled, parallel study (MENDS)’, Health Technology Assessment (Winchester, England), 16(40), pp. i–239. Available at: https://doi.org/10.3310/hta16400.
  3. Benedict, C. (2022) ‘Melatonin’s Potential Side Effects: It May Be in Your Genes’, Mayo Clinic Proceedings, 97(7), p. 1401. Available at: https://doi.org/10.1016/j.mayocp.2022.05.011.
  4. Besag, F.M.C. et al. (2019) ‘Adverse Events Associated with Melatonin for the Treatment of Primary or Secondary Sleep Disorders: A Systematic Review’, CNS drugs, 33(12), pp. 1167–1186. Available at: https://doi.org/10.1007/s40263-019-00680-w.
  5. Besag, F.M.C. and Vasey, M.J. (2022) ‘Adverse events in long-term studies of exogenous melatonin’, Expert Opinion on Drug Safety, 21(12), pp. 1469–1481. Available at: https://doi.org/10.1080/14740338.2022.2160444.
  6. Foley, H.M. and Steel, A.E. (2019) ‘Adverse events associated with oral administration of melatonin: A critical systematic review of clinical evidence’, Complementary Therapies in Medicine, 42, pp. 65–81. Available at: https://doi.org/10.1016/j.ctim.2018.11.003.
  7. Gilbert, S.S. et al. (1999) ‘Peripheral Heat Loss: A Predictor of the Hypothermic Response to Melatonin Administration in Young and Older Women’, Physiology & Behavior, 66(2), pp. 365–370. Available at: https://doi.org/10.1016/S0031-9384(98)00309-6.
  8. Givler, D. et al. (2023) ‘Chronic Administration of Melatonin: Physiological and Clinical Considerations’, Neurology International, 15(1), pp. 518–533. Available at: https://doi.org/10.3390/neurolint15010031.
  9. Händel, M.N. et al. (2023) ‘The short-term and long-term adverse effects of melatonin treatment in children and adolescents: a systematic review and GRADE assessment’, EClinicalMedicine, 61, p. 102083. Available at: https://doi.org/10.1016/j.eclinm.2023.102083.
  10. Hu, X. et al. (2023) ‘Neuroprotective Effect of Melatonin on Sleep Disorders Associated with Parkinson’s Disease’, Antioxidants, 12(2), p. 396. Available at: https://doi.org/10.3390/antiox12020396.
  11. Tarocco, A. et al. (2019) ‘Melatonin as a master regulator of cell death and inflammation: molecular mechanisms and clinical implications for newborn care’, Cell Death & Disease, 10(4), p. 317. Available at: https://doi.org/10.1038/s41419-019-1556-7.
  12. Tuft, C. et al. (2023) ‘Current Insights into the Risks of Using Melatonin as a Treatment for Sleep Disorders in Older Adults’, Clinical Interventions in Aging, 18, pp. 49–59. Available at: https://doi.org/10.2147/CIA.S361519.
  13. Yue, L. et al. (2019) ‘Melatonin Receptor Mel1b- and Mel1c-mediated Green Light Induced the Secretion of Growth Hormone in Anterior Pituitary of Chicks’, Photochemistry and Photobiology, 95(6), pp. 1387–1394. Available at: https://doi.org/10.1111/php.13127.
  14. Zhang, Z. et al. (2025) ‘Melatonin: A potential nighttime guardian against Alzheimer’s’, Molecular Psychiatry, 30(1), pp. 237–250. Available at: https://
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